船用变压器的额定电压设定为400V主要是出于以下几个方面的考虑：

1. 线路压降控制：电力在传输过程中会因为线路电阻而产生电压降。为了确保在最远端的用户处仍能得到足够高的电压，变压器的输出电压被设定得略高于用户的额定电压。这样即使有电压降，用户端的电压仍然可以保持在380V左右，这是许多工业和商业用电设备的典型额定电压。

2. 电压等级标准化：在电力系统中，380V和400V通常被视为同一电压等级。380V指的是用户端的电压等级，而400V则是指变压器二次侧的电压。这种标准化便于设备制造和系统设计，确保了全球范围内的兼容性。

3. 电力系统标准：不同国家和地区的电力系统标准可能存在差异，导致变压器低压侧的电压标准有所不同。在某些地区，400V是普遍采用的标准，以适应当地的电力网络和设备要求。

4. 无功损耗减少：较高的电压可以减少电路中的无功功率损耗，这是因为无功功率与电压的平方成正比。因此，使用400V电压可以提高电力系统的效率，减少能量损失。

5. 分接开关调节：变压器一次侧通常配备有分接开关，可以按照±5%的比例对电压进行调节。这种设计允许变压器根据实际需要调整输出电压，以应对电网波动或负载变化。

6. 设备兼容性：400V的电压设置确保了与现有电力设备的兼容性，避免了因电压不匹配而导致的设备损坏或性能不佳。

综合上述因素，变压器的额定电压被设定为400V，这既是一种工程实践的选择，也是电力系统设计和运营中的一种标准惯例。